La segunda sesión libre tuvo que interrumpirse a falta de 20 minutos para el final, y ya no volvió a reanudarse. Romain Grosjean abordaba la penúltima curva, cuando al subirse al piano, notó algo que impactaba en uno de sus neumáticos, perdió el control de su Haas y chocó con violencia contra los muros de protección. Bottas y Raikkonen también pasaron por el mismo lugar, y "de milagro" no impactaron contra esta rejilla. Grosjean no sufrió ningún daño, pero su Haas sí lo estaba.
La sesión se interrumpió definitivamente, quedando la clasificación de la FP2 con los tiempos marcados hasta ese momento. Los dos pilotos de Ferrari se impusieron sobre el resto, con Sebastian Vettel marcando un tiempo "estratosférico" que bate el récord absoluto de la pista de Sepang: 1'31"261. Su compañero Kimi Raikkonen no se quedó lejos, situándose a 6 décimas. En tercer y cuarto lugar los dos pilotos de Red Bull, Daniel Ricciardo por delante de Max Verstappen.
Por detrás, Fernando Alonso (McLaren), que volvió a demostrar que el McLaren está "entre los mejores", por lo menos en las sesiones libres, tanto en la FP1 bajo la lluvia, como en la FP2 sobre seco. El mejor tiempo que marcó Alonso fue de 1'32"564, lo que le situaba a 1,3 segundos del de Vettel. Tras Alonso los dos pilotos de Mercedes: Lewis Hamilton fue sexto y Valtteri Bottas séptimo, ambos a 1,4 segundos del mejor clasificado. Entre los 10 primeros se clasificó Checo Pérez (Force India), seguido de Nico Hulkenberg (Renault) y Esteban Ocon (Force India).
Carlos Sainz (Toro Rosso) que tuvo que ceder su volante al piloto Sean Gelael en la primera sesión, por fin pudo salir a rodar en la FP2, aunque desde el principio por radio se quejó de la dificultad que encontraba al pilotar su Toro Rosso STR12. "Pérdida de potencia", gritó por radio a su ingeniero muy poco antes de que la sesión se interrumpiera con la bandera roja, y fue hasta su box. Sainz se clasificó decimosexto a 2,8 segundos de Vettel.
Clasificación FP2:
1 Sebastian Vettel Ferrari 1m31.261s - 23
2 Kimi Raikkonen Ferrari 1m31.865s 0.604s 19
3 Daniel Ricciardo Red Bull/Renault 1m32.099s 0.838s 19
4 Max Verstappen Red Bull/Renault 1m32.109s 0.848s 11
5 Fernando Alonso McLaren/Honda 1m32.564s 1.303s 14
6 Lewis Hamilton Mercedes 1m32.677s 1.416s 15
7 Valtteri Bottas Mercedes 1m32.720s 1.459s 21
8 Sergio Perez Force India/Mercedes 1m32.862s 1.601s 20
9 Nico Hulkenberg Renault 1m33.060s 1.799s 24
10 Esteban Ocon Force India/Mercedes 1m33.096s 1.835s 24
11 Jolyon Palmer Renault 1m33.381s 2.120s 26
12 Felipe Massa Williams/Mercedes 1m33.394s 2.133s 20
13 Stoffel Vandoorne McLaren/Honda 1m33.673s 2.412s 15
14 Lance Stroll Williams/Mercedes 1m33.818s 2.557s 16
15 Pierre Gasly Toro Rosso/Renault 1m34.043s 2.782s 22
16 Carlos Sainz Toro Rosso/Renault 1m34.104s 2.843s 19
17 Romain Grosjean Haas/Ferrari 1m34.118s 2.857s 18
18 Kevin Magnussen Haas/Ferrari 1m34.343s 3.082s 17
19 Pascal Wehrlein Sauber/Ferrari 1m35.246s 3.985s 29
20 Marcus Ericsson Sauber/Ferrari 1m35.697s 4.436s 27
