La marca del doble chevrón incrementa su oferta de mecánicas de gasóleo con una versión potenciada de su motor 1.4 HDI de 68 CV. Este propulsor alcanza los 90 CV gracias a diversos cambios en el sistema de distribución, con la inclusión de una culata de 16 válvulas, y en el sistema de alimentación (nuevo turbocompresor de geometría variable y un cambiador de aire/aire). Las prestaciones de este motor le permiten un uso desahogado tanto en ciudad como en vías rápidas. Así, su velocidad máxima es de 180 km/h (165 en el HDI de 68 CV) y acelera de 0 a 100 km/h en 11,7 segundos (13,4 obtiene su hermano de 68 CV). En el tema de los consumos, ambos motores son casi parejos, con un incremento de 0,3 litros en uso urbano, y de 0,1 litros en uso mixto. Sin embargo, el HDI de 90 CV gasta menos en rango extraurbano.
El precio del C3 HDI 16V de 90 CV varía, según versiones, desde los 13.620 hasta los 15.763 euros (entre 2.266.177 y 2.622.743 pesetas), al que hay que restar el ya tradicional descuento de la marca, en esta ocasión de 1.500 euros (249.579 pesetas). La otra novedad de Citroën es la nueva caja de cambios con embrague pilotado Sensodrive que permite funcionamiento automático o manual a través de la palanca de cambios o unos mandos situados detrás del volante. El Sensodrive únicamente viene asociado al motor de gasolina más potente de la gama, el de 1,6 litros y 110 CV, y al acabado más completo, el SX Plus. Esta versión se venderá a partir de septiembre a un precio de 15.090 euros (2.510.765 pesetas) menos un descuento de 1.200 euros (200.000 ptas).